西河发源于苟家乡内火烧营北麓，向东流自鹞子岩出山口入平原，至元通与味江、干五里河、泊江汇合。元通以上又称文井江。自元通以下转向东南流，有沙沟河、向阳河、白马河流入。再向南流经三江镇的蒙渡入新津县境。全长109公里，市境内长96.8公里，流经14个乡镇，为全市最长河流。

　　黑石河又称"黑石大江"，于都江堰市柳街乡流入市境，向南流经9个乡镇，于三江大桥处与羊马河汇合流入新津县，总长65公里，市境内长32.15公里。
 
　　金马河系岷江之正流，自都江堰市沿江乡流入市境，沿市东界，断续为崇州与温江、双流的界河。市内河岸（右岸）全长10公里。

　　上述3条主要河流同市境内180多条大小支流相联结，在全市构成水道网，至新津县境内汇入岷江。 
　　崇州属四川盆地亚热带湿润季风气候，四季分明，春秋短，冬夏长，雨量充沛，日照偏少，无霜期较长。年平均气温15.9℃，最热月7月平均气温为25℃，最冷月1月平均气温为5.4℃温差为19.7℃。年平均日照时数为1161.5小时，年平均降雨量1012.4㎜，雨日和雨量均为夏多冬少，春季为176.1㎜，夏季为588.0mm，秋季218.4mm，冬季为29.9mm。风向频率以静风最多，占全年的37%；其次是北风，占9%。年平均风速为1.3m/s。平均霜日19天，平均无霜期为285天。年平均雪日3天，且雪量较小。主要灾害性天气为连续性阴雨、洪涝、干旱、大风、冰雹、寒潮、霜冻等。