全市总土地面积为1090.17k㎡。其中，山地面积471.52 k㎡,丘陵面积54.95 k㎡，平原面积563.7 k㎡。山、丘、坝内共有水域10万亩，全市大体形成"四山一水五分田"的土地结构。

　　矿产资源

　　崇州境内矿产资源丰富，现已发现的有14种，其中探明储量的5种：煤、铅、锌、石灰石和泥炭；尚未查明储量的9种：硫铁矿、银、金、云母、雄黄、石膏、铝、盐和天然气。矿点分布于苟家、万家、毛郎、怀远、街子、公议、王场、道明和隆兴等乡镇。其中，以煤、石灰石储量最多，正开采的矿种有3个：煤、石灰石和金。曾开采过的矿种有6个：泥炭、锌、硫铁矿和石膏。

　　水资源

　　除降水外，全市年河川径流总量为157074万立方米。其中都江堰输水量80511万立方米，本地河流水量73952万立方米，山丘塘库蓄水、机电提水、山溪沟引水和可利用的浅层地下水计2611万立方米。农业生产可利用水量为67648万立方米，平均每亩有水1090立方米。

　　全市水力资源丰富，理论蕴藏量总计为110900kw，可开发量为53605kw。

　　全市由河流、池塘、水库、水凼等构成水面共计10万亩，可供养殖的水面为3807亩。尚有可开发水面3500余亩。

　　生物资源

　　崇州属中亚热带湿润气候区，宜于生物生长。植物方面树种繁多，遍布山、丘、坝的乔、灌木，主要有65科300余种，药用植物占120余种。属国家保护的珍贵稀有树木5种：红豆树、水杉、珙桐、罗汉松和紫檀。

　　野生动物种类繁多，哺乳类、鸟类、鱼类、两栖类、爬行类、昆虫类以及软体类、节肢类、环节类等动物达数百种，珍稀动物有金丝猴、岩驴、獐子、扭角羚（即野牛）、大熊猫、小熊猫。名贵鸟类有相思鸟、百灵鸟、野雉、鹦鹉、贝母鸡等。此外，还有罕见的大鲵（娃娃鱼）和梆梆鱼（俗名）等。

　　崇州市是全国十四个熊猫生态自然保护区之一。
　　
　　林木资源

　　崇州地处亚热带常绿阔叶林、常绿、落叶阔叶林中。森林植被类型丰富，树种繁多，共有65科200余种。乔、灌、针、阔叶林木皆有。全市森林覆盖率为42.1%，分为高山水杉涵养区，中山用材、经济林区，丘陵薪炭、经济林区和平坝路旁综合区。全市活立木总蓄积量近百万立方米。